ＳＮＰ
（Single Nucleotide Polymorphism：スニップ）

DNAの塩基配列は，同じヒトであっても個人によって僅かずつ異なっていることがわかっています。例えば，第１２番目の染色体には，酒酔い遺伝子（アルデヒド脱水素酵素，aldehyde dehydrogenase 2； ALDH2）と呼ばれる部分があります。欧米人のように酒に強い人の塩基配列は，-ATACACT-G-AAGTGAA-であり，アジア人のように，酒に弱い人の塩基配列は，-ATACACT-A-AAGTGAA-とGとA以外の配列は同じですが，一塩基の違いでヒトの性質が異なります。これがSNP（スニップSingle Nucleotide Polymorphismの略＝一塩基多型）と呼ばれるもので，数多くあるのでSNPsと言います。SNPは数百から千塩基に一個の割合いで存在し，全ゲノム中には３００万〜１０００万個所もあると考えられています。このSNPが，病気の罹りやすさや薬の効きやすさなどで個人差があることと関連していると考えられます。現在，SNP を系統的に調べてデータベース化し，患者の体質にあった薬の処方や治療を行う，「テーラーメイド（オーダーメイド）医療」に高い関心が集められています。これを可能とするには，SNPsを迅速に分析できる方法の開発が極めて重要となります。

DNAの塩基配列を読み取る分析法として多くの方法が提案されていますが，時間がかかり費用も高い問題点があります。私たちは，脱塩基部位を持つDNAに着目しました。プリン塩基やピリミジン塩基が欠損した脱塩基DNAはヒトの細胞内で1日に1万個以上も生成しているものです。私たちはこの脱塩基部位を持つ人工DNAと分析したい塩基配列を持つDNAとで二本鎖を作らせ，標的塩基と水素結合する蛍光性小分子を脱塩基部位（AP site）に取り込ませることで，蛍光強度の変化からSNPを検出する方法を開発しました。また，この方法をp53ガン抑制遺伝子の検出に応用しました。p53という名前は，この遺伝子からできるタンパク質の分子量が約53,000であることに由来します。このp53遺伝子の異常は大腸ガンや肺ガンで高頻度に認められており，p53遺伝子に異常があると抗ガン剤が効きにくくなり，ガン細胞の細胞死（アポトーシス）を起こせずガン細胞が増殖することになります。そこで，正常なp53遺伝子をガン細胞に導入して細胞の増殖を抑制したり，アポトーシスを誘導する試みが行われています。


"Use of Abasic Site Containing DNA Strands for Nucleobase Recognition in Water"
Keitaro Yoshimoto, Seiichi Nishizawa, Masakazu Minagawa , and Norio Teramae
J. Am. Chem. Soc., 125, (30) 8982-8983 (2003). [abstract]

SNPs detection using an abasic site

Fluorescence detection of the P177R point mutation (C/G) in the p53
gene (5'-CTGCCYCCACC-3' / 5'-GACGGXGGTGG-3'; Y=C(normal) or
G(mutation), X=AP site)

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